MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011989	CTC	2	6	189297	189302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_011989	A	6	6	189430	189435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011989	T	6	6	189452	189457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011989	ACAA	2	8	189963	189970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_011989	GC	3	6	189984	189989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_011989	GCC	2	6	190028	190033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_011989	AGGC	2	8	190053	190060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_011989	GCC	2	6	195680	195685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_011989	GAG	3	9	195719	195727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011989	CG	3	6	195736	195741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_011989	AGGGT	2	10	195750	195759	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011989	CGG	2	6	198180	198185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011989	AAC	2	6	198233	198238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011989	TGA	2	6	198809	198814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011989	GCTC	2	8	198881	198888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_011989	GCC	2	6	198947	198952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_011989	GGC	2	6	198960	198965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011989	GCT	2	6	198981	198986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011989	GTT	2	6	199205	199210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011989	GTG	2	6	199293	199298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011989	T	6	6	199598	199603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011989	CGC	2	6	199632	199637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_011989	ATG	2	6	199841	199846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011989	GAG	2	6	199853	199858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011989	TAA	2	6	200459	200464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011989	T	6	6	200495	200500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011989	ATC	2	6	200513	200518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011989	CAA	2	6	200585	200590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011989	GAA	2	6	204209	204214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011989	TGC	2	6	204951	204956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011989	TG	3	6	204958	204963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011989	TGT	2	6	205569	205574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011989	GCA	2	6	205632	205637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011989	GCC	2	6	206287	206292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011989	TGG	2	6	207088	207093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011989	CT	3	6	207957	207962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_011989	CAT	2	6	209823	209828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011989	GCT	2	6	209859	209864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011989	GCA	2	6	212445	212450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011989	TCG	2	6	212458	212463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_011989	ATC	2	6	212491	212496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011989	TG	3	6	212569	212574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011989	CAC	2	6	212632	212637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_011989	CATG	2	8	212675	212682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_011989	GCG	2	6	214638	214643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011989	ACA	2	6	214723	214728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011989	GGAT	2	8	214744	214751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011989	CTG	2	6	214789	214794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011989	AAT	2	6	220049	220054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011989	T	6	6	220086	220091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011989	GGC	2	6	220169	220174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011989	CAC	2	6	222025	222030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_011989	CAG	2	6	222107	222112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011989	CGC	2	6	222120	222125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_011989	AGGCA	2	10	222152	222161	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
556	NC_011989	GACC	2	8	222164	222171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011989	A	6	6	222190	222195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011989	GAAG	2	8	222278	222285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011989	GATC	2	8	222293	222300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_011989	AGGG	2	8	222380	222387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011989	CA	3	6	222414	222419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_011989	TGC	2	6	222477	222482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011989	CGGG	2	8	222500	222507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
564	NC_011989	AT	3	6	222510	222515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011989	CGG	2	6	222524	222529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011989	GC	3	6	222594	222599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_011989	GTG	2	6	223135	223140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011989	CGGG	2	8	223212	223219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
569	NC_011989	GAC	2	6	223239	223244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011989	AAC	2	6	223263	223268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011989	GCTAT	2	10	223286	223295	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
572	NC_011989	GCC	2	6	223306	223311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_011989	AGC	3	9	223377	223385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011989	A	7	7	223407	223413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011989	T	6	6	223423	223428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011989	GGGC	2	8	223470	223477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
577	NC_011989	AAC	2	6	223526	223531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011989	TC	3	6	224637	224642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_011989	AAG	2	6	224750	224755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011989	CAA	2	6	224773	224778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011989	GGA	2	6	232387	232392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011989	CGG	2	6	232942	232947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011989	GGC	2	6	234661	234666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011989	CAT	2	6	234712	234717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011989	ATC	2	6	236460	236465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011989	CGC	2	6	237266	237271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_011989	GCTC	2	8	237974	237981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_011989	A	6	6	238871	238876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011989	GA	4	8	238998	239005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011989	GCC	2	6	239937	239942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_011989	CGG	2	6	239955	239960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011989	CGC	2	6	242490	242495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_011989	GCTT	2	8	242508	242515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_011989	CAT	2	6	244443	244448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011989	TGA	2	6	244452	244457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011989	AAC	2	6	245050	245055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011989	ATC	2	6	245194	245199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011989	GGT	2	6	246684	246689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011989	AGCGCC	2	12	246703	246714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
600	NC_011989	TCA	2	6	246825	246830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011989	AAT	2	6	246852	246857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011989	AT	3	6	246931	246936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011989	AGC	2	6	247036	247041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011989	TC	3	6	248489	248494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_011989	TC	3	6	248531	248536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_011989	CAT	2	6	248568	248573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011989	TAC	2	6	248620	248625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011989	GAC	2	6	248658	248663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011989	T	6	6	248681	248686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011989	ATG	2	6	248696	248701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011989	TCCT	2	8	248755	248762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_011989	TCA	2	6	248778	248783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011989	ATT	2	6	248810	248815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011989	ATT	2	6	248913	248918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011989	T	8	8	248968	248975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011989	A	6	6	249024	249029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011989	GATT	2	8	249033	249040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011989	TGG	2	6	249739	249744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011989	AGC	2	6	249763	249768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011989	TGA	2	6	250014	250019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011989	GAT	2	6	250027	250032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011989	GTG	2	6	250042	250047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011989	ATCC	2	8	251304	251311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_011989	AT	3	6	251354	251359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011989	GT	3	6	252620	252625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011989	CCAAT	2	10	252706	252715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
627	NC_011989	GCG	2	6	255723	255728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011989	AGTGA	2	10	255772	255781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011989	TCA	2	6	255795	255800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011989	TTCC	2	8	255826	255833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_011989	A	6	6	255838	255843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011989	GCG	2	6	255871	255876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011989	CGC	2	6	255915	255920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_011989	C	6	6	255947	255952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
635	NC_011989	GTC	2	6	255983	255988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011989	GCC	2	6	255994	255999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_011989	GAC	2	6	256009	256014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_011989	T	6	6	256015	256020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011989	ATC	2	6	256082	256087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_011989	CGA	2	6	258022	258027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_011989	AGG	2	6	258197	258202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_011989	CAT	2	6	281093	281098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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685	NC_011989	CAT	2	6	281140	281145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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766	NC_011989	ATG	2	6	333775	333780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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768	NC_011989	GAC	2	6	334784	334789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_011989	GA	3	6	334918	334923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
771	NC_011989	TCG	2	6	335201	335206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_011989	T	7	7	335262	335268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_011989	TCA	2	6	335273	335278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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